Lynn und Emil Costa arbeiten seit drei Jahren als Wissenschaftler an Bord der Enterprise. Das berühmte Wissenschaftlerpaar arbeitet nun am Projekt Mikrokontamination. Doch das Zusammenleben der beiden gestaltet sich schwierig, die Ehe scheint gescheitert, Konflikte bestimmen ihren Alltag. 
Um den Wissenschaftlern eine Chance zu geben in Ruhe miteinander zu reden, schlägt Counselor Troi einen Urlaub an Bord der neuen Starbase der Föderation vor, die in wenigen Tagen eingeweiht werden soll. Doch bevor die Enterprise in den Orbit schwenken kann, stirbt Dr. Lynn Costa.

Die Suche nach der Todesart und der Todesursache beginnen. War es ein Unfall, Selbstmord oder sogar Mord? Sicherheitschef Worf und Counselor Troi werden vom Captain mit der Ermittlung beauftragt.
 

Kontamination ist ein Detektivroman in Star Trek Ambiente, mit allen dazugehörigen formalen Aspekten: Verbrechen, Ermittlung und natürlich der Lösung des Falles. Die Rollen der Detektive übernehmen Worf und Troi. Schon deshalb nimmt John Vornholts Buch eine Sonderstellung unter den Star Trek Romanen ein. 

Eine weitere Besonderheit macht die Tatsache aus, dass fast der komplette Roman an Bord der Enterprise spielt und dem Leser einen Einblick in den Alltag und die Struktur einer wissenschaftlichen Abteilung gibt. Es wird deutlich, dass die Besatzung der Enterprise keine große Familie ist, sondern dass es viele voneinander unabhängige Abteilungen gibt, die getrennt voneinander leben und arbeiten, vereint sind sie durch ihren Lebenslauf, die U.S.S. Enterprise.